Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms