Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EXT1Q16394 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms