Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VPS72Q15906 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VPS72Q15906 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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