Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SS18Q15532 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms