Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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