Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms