Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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