Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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SHPRHQ149N8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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SHPRHQ149N8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHPRHQ149N8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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