Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR1D2Q14995 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms