Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CLINT1Q14677 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CLINT1Q14677 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms