Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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CBFBQ13951 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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CBFBQ13951 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CBFBQ13951 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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