Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms