Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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