Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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DNASE1L3Q13609 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNASE1L3Q13609 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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