Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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TRAF1Q13077 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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