Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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MKRN3Q13064 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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MKRN3Q13064 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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MKRN3Q13064 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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MKRN3Q13064 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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MKRN3Q13064 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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