Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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ANK3Q12955 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ANK3Q12955 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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