Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TROQ12816 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TROQ12816 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TROQ12816 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TROQ12816 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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