Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms