Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXM1Q08050 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXM1Q08050 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms