Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
KRTAP1-1Q07627 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms