Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTDSPL2Q05D32 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms