Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F1Q01094 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms