Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GTF2BQ00403 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms