Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAP84074 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HPCAP84074 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HPCAP84074 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HPCAP84074 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms