Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COG7P83436 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COG7P83436 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COG7P83436 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms