Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX1P78337 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX1P78337 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms