Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms