Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms