Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMARCA2P51531 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms