Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTBP49356 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTBP49356 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FNTBP49356 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms