Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNI2P48788 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms