Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LTBRP36941 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LTBRP36941 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LTBRP36941 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LTBRP36941 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms