Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC8A1P32418 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms