Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC27P30260 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC27P30260 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC27P30260 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms