Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLD1P28340 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLD1P28340 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLD1P28340 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLD1P28340 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLD1P28340 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms