Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ITGA3P26006 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ITGA3P26006 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ITGA3P26006 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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