Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms