Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XBP1P17861 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
XBP1P17861 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
XBP1P17861 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms