Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN1P12814 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms