Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB5P09067 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms