Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRCP08575 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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