Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms