Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIN3BO75182 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms