Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN8O00124 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms