Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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