Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PAXBP1Q9Y5B6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms