Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KLF12Q9Y4X4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms