Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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IFT52Q9Y366 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IFT52Q9Y366 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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IFT52Q9Y366 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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IFT52Q9Y366 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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IFT52Q9Y366 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
IFT52Q9Y366 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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