Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPS5Q9UPZ3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms